强巴林寺位于昌都镇内的四级台地上，寺内主佛为强巴（大慈）佛，故对该寺的起名为昌都强巴林寺。该寺僧人多时达5000余人，周围有小寺70座，是康区规模较大的寺庙。

该寺主要建筑保存完好，经堂内塑有数以百计的各类佛像和高僧塑像，上千平方米的壁画以及众多的唐卡画，可以说是汇集了昌都能工巧匠的聪明才智。

传说格鲁派宗师宗喀巴16岁时在学经途中，路过这两水交汇的秀美之地时预言这里将是弘扬佛法之地。建寺时西饶桑布在一千户家去讲经化缘，该千户就将自己家的草场奉献了出来作建寺之址。据说现在寺庙五大扎仓之一的桑堆扎仓的位置，就是当年千户搭牦牛帐篷的地方。