吉林大学博物馆是学校直属业务单位，下设两个分馆（地质博物馆、考古与艺术博物馆）和一个依托博物馆建立的“吉林大学恐龙演化研究中心”。博物馆以藏品丰富，特色鲜明享誉中外，是我国乃至亚洲的高等院校博物馆之一。

博物馆集“科研、教学和科普”于一体，岩矿化石标本门类齐全、文物及考古标本典藏丰富，有关的地学与考古学资料积累也相当雄厚。馆内拥有采自全国各地及世界上30多个国家和地区的展品两万余件，其中不乏东北地区完整的鸭嘴龙化石——嘉荫卡龙、吉林省出土的一具恐龙化石骨架——长春龙、商代的甲骨和青铜器、南宋岳飞印等传世珍品 。博物馆建有国际水平的微体古生物化石实验室。作为依托高校建设的场馆，博物馆的科学研究和国际交流相当频繁，尤其近年来开展的“吉林中部白垩纪脊椎动物群”研究取得了一系列在国内外具有重要影响力的研究成果。