神农溪原名沿渡河，后因传说中神农炎帝在搭架采药后顺溪而下，改为神农溪。整条溪流共分3个峡段（由长江交汇口向内依次为：龙昌峡、鹦鹉峡、神农峡）和1条支流（绵竹峡），目前游客游览时，全程都是乘船游玩，往返耗时约4小时。

游客从位于巴东县城长江边的码头登上游船，船开大约五分钟后就进入了神农溪的龙昌峡段。人在船中，四周望去，满目青翠，两边的山岩多成80度至90度斜坡直插溪底。溪水碧绿，水面的宽度不超过30米。船行在溪流中，两岸的峭壁上植被茂盛，处处可见山花烂漫，有时你能够看到猴群和獐羊攀援嬉戏的山野情趣。除此之外，还能在两岸的几处绝壁洞口边上看到一些古老的神秘悬棺，在劳动工具极其简陋的四千多年前，古人是怎样把棺木放在这悬崖绝壁间的？至今还是千古之谜。

游船行驶到绵竹峡水面宽阔处，将换乘景区提供的筏浆木船，木船形如豌豆荚，当地人称“豌豆角”。每条船上一般会有船工和土家族导游，有时导游会高歌一曲当地民歌。游船在罗坪码头（罗坪接待中心）泊岸后，导游会带领游客们观看当地的民族表演，还有船工们的三峡纤夫拉纤表演（拉纤表演多在上午，午后因天气的原因，有时会取消）。